Биоинформатика для трансляционной медицины

Зачетные единицы: 5

Семестр: 3

Курс: По выбору

Цели

Студенты изучат способы компьютерного представления биологических объектов, методы онтологического моделирования, языки программирования и программно-инструментальные средства в биоинформатике, методы интеграции приложений в биоинформатике, алгоритмы анализа генетических последовательностей, особенности математического моделирования динамики функционирования живых систем на различных иерархических уровнях их организации.
Студенты научатся проводить анализ данных в клинических условиях, осуществлять быстрый поиск генетических последовательностей в банках данных.
Студенты овладеют методами анализа генетических последовательностей и их адаптации к высокопроизводительным вычислительным системам, методами выравнивания последовательностей.

Содержание

Основные темы занятий в рамках дисциплины:

  • Введение в биоинформатику и информационную биологию
  • Базы данных и информационные системы в биоинформатике
  • Методы анализа данных и текстовой информации в биологии
  • Представление и анализ сетевых моделей сложных биологических систем (генные сети, ассоциативные сети)
  • Высокопроизводительные вычисления в биоинформатике
  • Вычислительный анализ методов молекулярного профилирования
  • Оценка классификации подтипов опухоли

Формат

Лабораторные работы

Университет Амстердама

Оценка

Экзамен